１０月７日，普加喬夫率起義軍進攻奧倫堡，因兵力懸殊，沒有成功。于是他決定采用圍城打援的戰略，長期圍困奧倫堡。在此期間，普加喬夫成立了軍事委員會，加強部隊建設。同時，普加喬夫展開了大量的宣傳鼓動工作，到處傳布檄文，聲稱要給哥薩克“河川、土地、草原、薪餉、武器和糧食；”給巴什基爾人、哈薩克人、卡爾梅克人和韃靼人“土地、水源、草場、森林、自由和糧食”。號召各族人民起義推翻葉卡杰琳娜二世。

　　哥薩克的農民、工人和各族人民紛紛投奔起義隊伍。

　　起義軍很快發展到３萬多人，葉卡杰琳娜二世驚惶失措，急忙調動三路大軍，增援奧倫堡。第一路大軍的主力有２萬多人，由卡爾將軍率領。他根本沒把普加喬夫放在眼里，認為起義軍不過是烏合之眾，不堪一擊，自己一定馬到成功。卡爾帶著隊伍漫不經心地向奧倫堡開來，心里想，這次打了勝仗一定會得到皇上重賞。他正在做美夢呢，突然一陣炮響，幾顆炮彈正落在他的隊伍中間，他自己猛然一驚，險些從馬背上跌了下來，原來他中了普加喬夫的埋伏。卡爾剛下令還擊，起義軍的騎兵已經發起猛攻，揮舞著雪亮的馬刀，像一陣旋風刮了過來。官兵倉惶應戰，哪還招架得住，不會兒就四散潰逃，卡爾早就扔下隊伍自己先跑了。

　　第二路援軍緊隨而來。普加喬夫帶兵埋伏在一個山頭上，山下是一條河。官兵在本爾內舍夫上校率領下來到河邊，這正是１１月份，河上結著薄冰，寒風刺骨。本爾內舍夫向四處觀察了一會兒，只見周圍靜悄悄的，心中祈禱千萬別遇上普加喬夫的埋伏。他下令隊伍立即過河。

　　官兵剛到河中間，突然一陣炮響，起義軍從河邊的山頭上沖了下來，吶喊聲驚天動地，陷入包圍的官兵還沒來得及抵抗就當了俘虜。本爾內舍夫見勢不妙，急忙化裝成馬車夫想逃走，結果被起義軍抓住，當場處死。第三路援軍聽見兩路人馬潰敗的消息，不敢大意，繞路沖到奧倫堡城下，被守城的官兵接了進去。

　　１７７４年春天，葉卡杰琳娜二世再次派大軍增援奧倫塞，３月２２日，雙方在謝季塔瓦展開激戰，起義軍遭到失敗。４月１日，起義軍在薩馬拉激戰中再次受挫，只好從奧倫堡撤退，向巴什基爾地區轉移。在撤向巴什基爾地區的路途中，許多工人，農民和巴什基爾人加入了起義隊伍。７月１２日，普加喬夫把起義分成四個縱隊，向俄國南方另一軍事重鎮喀山發動猛攻。經過激烈戰斗，起義軍攻破喀山城，政府軍倉惶逃走。兩天后，官兵立即反掉過來，起義軍只得棄城而走。在喀山戰斗中，起義軍陣亡和被俘約８０００人，使新補充的隊伍幾乎全部喪失了。普加喬夫從喀山撤退，西渡伏爾加河，向頓河挺進，打算發動頓河地區的哥薩克，去攻打察里津，然后進攻莫斯科。

　　在西進途中，沿途又有無數群眾參加起義，起義很快席卷了諾夫哥羅德省和沃龍涅什省。這些西方的幾千名貴族倉惶逃往莫斯科。葉卡杰琳娜二世驚恐萬狀，急忙從土耳其戰場上調回蘇沃洛夫的部隊去追擊普加喬夫。當普加喬夫的起義軍剛剛逼近察里津，剛準備攻城，蘇沃洛夫的部隊就尾隨而來。８月２５日凌晨，雙方在薩爾尼科夫展開決戰，起義軍被擊潰。

　　普加喬夫帶領２００多名殘部，東渡伏爾加河，逃往草原深處。隊伍不斷縮小，最后剩下不到５０人了。

　　１７７４年９月４日，起義軍軍事委員會成員特沃洛戈夫，炮兵長官丘馬科夫等叛徒，把普加喬夫捆綁起來，交給了雅伊克鎮的沙皇政府當局。

　　１７７５年１月１０日，普加喬夫在莫斯科被沙皇殺害。俄國歷史是最大的一次農民起義被鎮壓下去了。但普加喬夫卻永遠受到俄羅斯人民的尊敬。