讓人又感到遺憾的是，當時青霉素還無法馬上用于臨床治療，因為青霉素培養液中所含的青霉素太少了，很難從中提取足夠的數量供治療使用。如果直接用它的培養液來治病，那一次就要注射幾千甚至上萬毫升，這在實際上無法辦到。因此，弗萊明只好暫時停止了對青霉素的培養和研究工作。但是他的發現，為后來的科學家開辟了道路。

　　時間到了１９４０年，在牛津大學主持病理研究工作的澳大利亞病理學家佛羅理，仔細閱讀了弗萊明關于青霉素的論文，對這種能殺滅多種病菌的物質產生了濃厚的興趣。但是他知道，要提取出這種物質，需要各方面科學家的共同努力。他邀請了一些生物學家、生物化學家和病理學家，組成了一個聯合實驗組。這之中，德國生物化學家錢恩是他最主要和得力的助手。在佛羅理的領導下，聯合實驗組緊張地開展了研制工作。細菌學家們每天要配制幾十噸培養液，把它們灌入一個個培養瓶中，在里面接種青霉菌菌種，等它充分繁殖后，再裝進大罐里，然后送到錢恩那里進行提煉。

　　提煉工作繁重而艱難，一大罐培養液只能提煉出針尖大小的一點點青霉素。經過幾個月的辛勤工作，錢恩提取出了一小匙青霉素。把它溶解在水中，用來殺滅葡萄狀球菌，效果很好。即使把它稀釋二百萬倍，仍然具有殺滅能力。聯合實驗組選擇了５０只小白鼠來進行試驗；把每只都注射了同樣數量，足以致死的鏈狀球菌，然后給其中２５只注射青霉素，另外２５只不注射。

　　實驗結果，不注射青霉素的白鼠全部死亡，而注射的只有一只死去。隨后，他們開始了更努力的提取工作，終于獲得了能救活一個病人所需的青霉素，并救活了一名病人。證明了這種藥物的無比效能。

　　佛羅理清醒地意識到，為青霉素能廣泛地用于臨床治療，必須改進設備，進行大規模生產。但這對聯合實驗組來說，還是無法辦到的事。而且，當時的倫敦正遭受德國飛機的頻繁轟炸，要進行大規模生產也很不安全。

　　１９４１年６月，佛羅理不顧錢恩的反對，帶著青霉素樣品來到不受戰火影響的美國。他馬上與美國的科學家們開始合作。經過共同努力，終于制成了以玉米汁為培養基，在２４℃的溫度下進行生產的設備。用它提煉出的青霉素，純度高，產量大，從而很快開始了在臨床上的廣泛應用，一些傳染病的死亡率大大下降，無數人的生命得到了拯救。

　　１８４５年，弗萊明、佛羅理和錢恩三人，因在青霉素發現利用方面做出的杰出貢獻，共同獲得了諾貝爾生理學及醫學獎金。